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哥伦比亚大学医学院

仪器仪表资源设施

IRF的使命是为哥伦比亚医学院和南加州大学主校区的研究环境提供最先进的生物医学研究仪器。在时间和资源允许的情况下,也允许和鼓励外部使用该设施。

最先进的生物医学研究设备

仪器资源设施(IRF)是南卡罗来纳大学医学院研究和教学任务的一个组成部分。bob官方体育登陆

该设施内有几台最先进的生物医学研究设备,提供从整个动物到单细胞成像到分子水平分析的技术。

IRF还设有全套的辅助设备,可用于样品制备。除了作为获取原始数据的资源外,IRF还具有图像增强和相关数据分析的能力。

服务范围包括:

  • 共焦成像
  • 电子显微镜
  • 组织学
  • 仪器培训
  • 流式细胞仪/细胞分选
  • 海报印刷IRF仅供南加州大学SOM研究学院和学生使用。
  • Bio-Rad订购

    IRF每周向BioRad下订单。南加州大学内部客户可以通过IRF提交产品订单以获得医学院折扣。每周订单截止日期为周一12点截止日期后提交给核心的订单将在下一周处理。所有的订单都必须通过iLab

iLab门户

仪器仪表资源设施使用安捷伦CrossLab的iLab软件来管理设备可用性和服务请求。要开始使用iLab:

  • 注册帐户如果你是第一次使用。
  • 使用您的iLab证书登录在右上角,然后转到请求服务选项卡提交服务请求。
  • 参观客户帮助手册获取iLab核心设施服务的进一步指导。

我们的设备

PerkinElmer量子GX显微ct成像系统
Quantum GX microCT多物种成像系统可在足够低的x射线剂量下提供高分辨率图像,以实现真正的纵向成像能力。扫描时间低至8秒,Quantum GX支持每小时最多30个主题的工作流程,在一分钟内完成采集、重建和3D可视化。使用我们的AccuCT™先进的自动化用户友好的骨骼分析软件,自动化microCT成像分析,减少时间并提高再现性。Quantum GX是最多功能的小动物显微ct成像仪器,已被证明可广泛应用于肿瘤、肺部和心血管疾病、糖尿病、骨科和牙科等领域。

  • 高分辨率(4.5微米体素大小)
  • 高速(20 x 20毫米扫描8秒)
  • 纵向研究的低剂量成像
  • 功能性光信号与解剖显微ct成像的共配准
  • 两倍放大高,中,低分辨率
  • 两阶段呼吸和心脏门控
  • 小鼠/大鼠/兔子成像能力

位置
Quantum GX uCT位于1号楼B48室

IRF联系人
洛雷恩Junor


PerkinElmer IVIS光谱荧光和生物发光成像系统

IVIS光谱是IVIS系列产品中最新的仪器,可进行生物发光和外照射和反照射荧光成像。IVIS光谱在这一系列仪器中的独特之处在于能够灵敏地成像同一动物内的生物发光和荧光报告者,并提供所产生信号的光谱指纹。这是体内成像技术的一个重要进展,因为它允许从发射信号中分离自体荧光,提高信号分辨率。为了获得光谱指纹,Spectrum使用了一系列高效窄带通滤波器和光谱分解算法来区分多个浅荧光源和深荧光源。这提供了一种机制,以最佳地执行广泛的荧光/生物发光研究应用,我们的研究人员。该系统还能够对生物发光和荧光进行三维层析重建。

  • 高灵敏度的荧光和生物发光体内成像
  • 高通量(5只小鼠),视野23厘米
  • 高分辨率(20微米),3.9厘米视场
  • 28个高效滤波器,波长为430 - 850 nm
  • 支持光谱分解应用程序,这是理想的区分多种生物发光和荧光报告
  • 荧光照明路径中的光学开关允许反射模式或透射模式照明
  • 荧光和生物发光的三维漫反射层析重建
  • 能够导入和自动共注册CT或MRI图像,产生功能和解剖背景
  • NIST可追踪的绝对校准
  • 气体麻醉入口和出口。
  • 小鼠和大鼠的平台都是用来在麻醉期间维持体温的
  • 紧凑型异氟醚麻醉系统,氧气调节器和流量计

应用程序

在广泛的生物医学应用中有用,包括肿瘤学,心血管疾病,干细胞生物学,神经生物学,炎症,毒理学和药物代谢

位置
IVIS Spectrum酒店位于1号楼B48室

IRF联系人
洛雷恩Junor

网站


JL Shepherd和Associates 143-68型血液制品照射器

143型铯-137伽马辐照器是一个自给自足的全屏蔽单元,能够提供高达200伦琴/分钟的剂量率。最终样品剂量由照射时间决定,照射时间可由装置上的预设计时器控制。

应用程序
分子、细胞、组织、器官或整个动物的照射。

IRF联系
洛雷恩Lunor

莫纳克亚Cellvizio活体共聚焦
Cellvizio是一种双波段(488和660nm)探针共聚焦激光显微内镜系统。它是临床前研究细胞水平分子成像的理想选择。应用包括神经科学(脑深部成像)、癌症和炎症(脾脏、肝脏等)以及心血管(血管、斑块)的体内成像。成像是通过将一个小的光纤探头插入切口来完成的。

探针

  • 300mm斜面或平头(如果需要低侵入性,可对小鼠或其他器官进行脑深部成像)
  • 650mm平头(如果需要低侵入性,可对大鼠或其他器官进行深部脑成像)
  • 1.5mm圆形刀头(一般用途)
  • 4.2mm高分辨率100nm工作距离(血管和血管生成)
  • 1.8mm长工作距离(血液不穿透血管壁,肿瘤或器官深层细胞)
  • 超高分辨率(血管、血管生成、细胞形态)
  • MiniZ(蛀牙、眼睛)
  • Cerboplex(脑成像)

软件

超扫描模块超快速成像
血管检测软件自动圈定血管,毛细血管和血管床
马赛克软件为重建组织和器官拼接图像。

位置
Cellvizio位于9号楼小动物成像套房。

IRF联系
洛雷恩Junor

网站


Visual sonic VEVO 3100高分辨率活体成像系统
VEVO 3100是一种超高频超声成像系统,可同时以30毫米的分辨率实时获取体内纵向解剖、功能、生理和分子数据。用于在麻醉期间维持体温的小鼠和大鼠平台以及带有氧气调节器和流量计的紧凑型异氟醚麻醉系统均可提供。

软件包

  • 分析软件用于b模式图像捕获和分析,心电图在屏幕上的跟踪,测量和注释,cineloop图像回顾捕获和显示
  • m模式捕捉和分析软件的血管和心脏动力学特征,包括壁厚
  • 脉冲波多普勒包,可定量分析血流速度和波形测量
  • EKG和高级心血管
  • 软件包
  • 对比增强及微泡成像软件包
  • 显微镜下注射能力


Scanheads

  • MX 400 20-46 MHz,轴向分辨率为50um
  • MX 250 13-24 MHz,轴向分辨率为50um
  • MX 550 d
  • 三维运动

应用程序

  • 心血管-实现心腔和相关主要血管的生理功能的实时成像和分析,并能够监测心脏发育和病理过程中的形态变化。
  • 癌症生物学-在治疗期间对同一动物进行纵向研究时,可以对皮下和原位肿瘤生长的形状和大小进行2D和3D跟踪。软件允许对肿瘤大小进行容量分析,并跟踪肿瘤血管和血流。
  • 神经生物学-在颅骨骨化之前,可以实时监测胚胎或新生儿的大脑发育,细胞谱系研究,识别进行性神经退行性疾病,以及图像引导针注射和提取的可视化。
  • 发育生物学-从发育早期到成年的同一动物的纵向和维度评估,分析发育阶段的定时怀孕动物。

位置
VEVO 3100系统位于1号楼B48室。

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洛雷恩Junor

网站

逻各斯生物系统X-Clarity组织清理系统

Dako Autostainer

Dako Autostainer plus系统用于机器人处理免疫组织化学染色

Reichert-Jung 2030石蜡旋转切片机


徕卡VT1200S振动棒


蔡司Microm 505HN低温恒温器

尼康E600宽视场荧光和暗场显微镜系统
尼康E600配置包括:

  • 紫外,绿色,红色和远红色染料的激发和发射过滤器
  • 用于高分辨率暗场成像的光纤暗场照明器
  • 广泛的Plan和Plan- fluor目标范围从4X到100X油
  • 相位和DIC物镜和冷凝器
  • Micropublisher数码相机与Qimaging软件


位置
E600系统位于1号楼B59室

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洛雷恩Junor安娜·哈珀


发现回声旋转显微镜

  • 亮场和荧光宽视场显微镜

位置
回声旋转系统位于1号楼B59室。

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洛雷恩Junor安娜·哈珀

蔡司立体声Lumar V.12立体显微镜

蔡司Lumar V.12系统包括:

  • 用于EGFP,罗丹明,CFP, YFP, Cy3和DAPI范围染料荧光成像的滤光片
  • 液晶冷光源用于透射光成像
  • 光纤照明源
  • 蔡司Axiocam MRm数码相机与Axiovision软件

位置
Lumar V.12系统位于1号楼B59室。

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洛雷恩Junor

Invitrogen EVOS FL自动细胞成像系统
EVOS是一种全自动、数字倒置多通道荧光和透射光成像系统,配备:

  • 发光立方体:Dapi, GFP,德州红和Cy5
  • 4X, 10X阶段,20X, 20X阶段,40X和60X目标
  • 容器支架:双滑动,多孔,35mm盘,60mm盘,100mm盘,T-25烧瓶和T-75烧瓶

网站

IRF联系人
洛雷恩Junor安娜·哈珀

徕卡SP8多光子共焦
SP8 TCS多光子系统是一个最先进的平台,配备:

  • 立式DM6000 CFS显微镜
  • 10X干,20X干,25X水浸,40X水,63X油,x清晰度25X物镜
  • 两个内部PMT检测器
  • 两个内部HyD探测器
  • HyD-RLD高灵敏度探测器
  • 488nm, 552nm和638nm激光可见激光
  • 相干变色龙Ultra II 680-1080可调谐激光器
  • LAS AF三维分析软件

位置
徕卡SP8系统位于9号楼(只有非va研究人员才能通过IRF人员访问)

IRF联系
安娜·哈珀

网站


徕卡星5 LIAchroic
蔡司LSM 510 META CSLM是一款单光子光谱成像系统。IRF系统配备:

  • UV, 5固定二极管激光器405nm, 448nm, 488nm, 514nm, 561nm, 638nm
  • HyD S探测器
  • 透射光
  • 10X, 20X, 25X水,40X油,63X油物镜
  • 软件包包括LASX 3D
  • 闪电超分辨率能力


位置
徕卡Stellaris 5系统位于1号楼B60室。

IRF联系人
安娜·哈珀

JEOL 1400 Plus透射电子显微镜

JEOL 1400 +透射电子显微镜是用于生物超微结构成像的标准TEM系统。IRF系统配备:

  • 钨丝
  • 分辨率0.2nm
  • 串行EM程序断层扫描(+/- 60o倾斜)和拼接
  • 加速电压可调至120kV
  • 先进的显微镜技术侧面安装8K底部安装数码相机\

应用程序

  • 高分辨率超微结构成像
  • 胶体金和其他电子密集探针的免疫细胞化学
  • 断层摄影术
  • 衍射

位置
JEOL 1400 Plus系统位于1号楼B59室

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瑞安球


Jeol JSM it100

扫描电子显微镜是一种完全集成的数字高真空系统。IRF内的系统配备有:

  • 钨filiment
  • 高分辨率二次和电视速率背向散射探测器
  • 副模分辨率3.5nm
  • 10nm后向散射模式分辨率
  • 样品大小可达直径5英寸可以完全成像
  • 电动X-Y工作台,可驱动到存储位置
  • 预设Z工作距离为8、15、25、39、48mm
  • 在48毫米的工作距离内,倾斜能力为-5到+ 90的优心级
    360旋转
  • 加速电压0.5-30kV
  • 放大倍数从5x - 300000 x
  • 远景软件包
  • 宝丽来胶片和数字图像存储

应用程序

  • 生物和材料样品的表面形貌成像
  • 成像细胞:细胞与细胞:ECM相互作用
  • 胶体金表面分子的免疫细胞化学

位置

JEOL JSM IT100系统位于IRF 1号楼B59室。

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瑞安球


徕卡Ultracut R超微切片


极化子溅射涂布机



Reichert U3超微切片仪



Tousimis Samdri-PVT-3B临界点干燥机

Amira 5 &6
Amira工作站计算机位于1号楼B60室

IRF联系人
洛雷恩Junor


LASX 3 d
LASX 3D软件位于徕卡Stellaris 5和SP8共聚焦显微镜上。

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安娜·哈珀

BD FACS Aria II
FACS-Aria II高效细胞分选仪是流式细胞仪,能够每秒分选多达70,000个事件,同时保持培养细胞的活力和功能。这使得它成为无菌细胞分选的理想系统,用于分离罕见的细胞事件,如干细胞、树突状细胞和NKT细胞,这些细胞在大种群中通常只占总细胞的1%到2%。

  • 固态488和640激光器和分拣能力。
  • 自动细胞沉积单元和气溶胶管理系统。
  • 488线有正向和侧面散射和4个荧光探测器。640线有2个荧光探测器。
  • 二路和四路分选为12X75mm管,15ml管,载玻片或培养板。
  • 流体与70,85和100微米喷嘴尖端。
  • 温度控制选择冷却的分类收集设备-管和板
  • 用于488激光器的光学滤光片包括FITC, PE, PE- texas Red, PerCP, CY5.5和PECY7。
  • 640激光器的滤光片包括APC- cy7, Alexa700, APC
  • 计算机和FACSDIVA软件
    打印机

应用程序

  • 细胞表面抗原和生物标志物分析
  • Immunophenotyping
  • 单元格大小和粒度
  • 干细胞和造血细胞谱系研究
  • 血液学
  • 细胞凋亡,活/死细胞测定
  • 细胞周期研究
  • 干细胞4路分选
  • 细胞活力和功能测定
  • 稀有细胞群分选
  • 玻片和培养板的分类

位置
FACS Aria II位于1号楼B44室。

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杰森Kubinak


BD FACS Symphony A5细胞分析仪
BD FACS Symphony A5细胞分析仪是为细胞和荧光颗粒的生物和物理特性的定性和定量测量而设计的。本系统配备:

  • 5种激光355nm, 405nm, 488nm, 561nm, 640nm

位置
BD FAC Symphony A5位于1号楼B44房间

IRF联系
杰森Kubinak

AFP x射线胶片处理机

自动x射线胶片处理西部片等。

4X4英寸(10X10cm)到14X36英寸(35X91cm)薄膜
每小时可加工85张
时间和温度可调,可控制显影

位置
建筑28

IRF联系
瑞安球


BioRad BioPlex 100和200系统
BioPlex系统是一个多重分析系统,允许同时分析多达100(或200)个不同的生物分子(蛋白质,多肽或核酸)在一个微孔板。通过与Bio-Plex系统的多路复用,研究人员可以极大地增加来自罕见或体积有限的样本(如小鼠或大鼠血清)的有用信息量,并破译参与信号转导途径的蛋白质之间的复杂相互关系。该微孔板平台可在30分钟内自动分析96孔板,通量超过1800个化验点(23倍分析)。Bio-Plex悬架阵列围绕三大核心技术构建:

第一种是Luminex公司的荧光染色微球系列。
第二种是带有两个激光和相关光学仪器的流式细胞仪,用于测量微球表面发生的生化反应。
第三是一个高速数字信号处理器,以有效地管理荧光输出。

应用程序

  • 细胞因子和磷酸化蛋白的多重分析,使用BioRad提供的试剂盒
  • 通过BioRad提供的试剂盒将抗体偶联到珠子,对多种蛋白质进行多重分析

位置
BioPlex 100系统位于1号楼B60室。BioPlex 200系统位于9号楼225室。

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杰伊•波茨

网站


BioRad GelDoc XR+系统和iMark微孔板吸光度仪
核酸、蛋白质凝胶和印迹的快速成像、记录和分析系统。iMark微孔板吸光度仪是一个8通道,垂直路径长度光度计,可测量96孔微孔板孔中内容物的吸光度。它可以进行单波长或双波长测量,并可以报告吸光度值到小数点后三位。

位置
GelDoc和Microplate阅读器位于1号楼B60室


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洛雷恩Junor

网站


LiCor奥德赛CLX系统

位置
位于1号楼B59室。

IRF联系
洛雷恩Junor

网站


NanoPhotometer珍珠
核酸dsDNA, ssDNA, RNA和寡核苷酸的微升样品分析,蛋白质和蛋白质染料的标记效率,Bradford, Lowry, BCA和Biuret应用

位置
纳米伯爵位于1号楼B60室

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洛雷恩Junor

网站


QIAgility
QIAgility和Rotor-Gene Q Real time PCR设备提供了紧凑的台式仪器,可实现快速、高精度的PCR设置。无与伦比的多用途的QIAgility意味着几乎所有管和板格式的支持,以及转子光盘转子基因Q. QIAgility是通过计算机操作与易于使用的软件。

应用程序

  • 所有格式的自动PCR设置
  • 方便、易用的软件
  • 标准化的结果和提高的生产力
  • 消除人工移液步骤
  • 与QIAGEN样品技术无缝集成
  • 出色的热和光学性能,由于旋转格式
  • 从紫外到红外波长的无与伦比的光学范围
  • QIAGEN分析仪在多种应用中具有高性能

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杰伊•波茨

位置
Qiagility系统位于9号楼225室。

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QIAsymphony系统
QIAsymphony SP有一系列专门的QIAsymphony试剂盒,可以从广泛的起始材料中制备DNA、RNA、细菌和病毒核酸的样品。QIAsymphony AS通过集成自动PCR检测设置扩展了QIAsymphony SP的功能,该功能与Rotor-Gene Q和QIAGEN实时和终点PCR试剂盒相结合,使您能够优化PCR工作流程并最大限度地提高效率。

应用程序

  • 从广泛的样品中纯化DNA和RNA
  • 自动转移洗脱物到QIAsymphony AS进行分析设置
  • 连续样品加载,条形码读取样品跟踪
  • 样品清单的导入和样品单的导出


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杰伊•波茨

位置
Qiasymphony位于9号楼225室。

网站


BioRad CFX Connect rtPCR
CFX连接实时PCR检测系统提供双目标分析,优秀的热循环仪规格,和相同的可靠性能CFX96 Touch™实时PCR检测系统.该系统结合了创新的光学技术和强大的软件,为您的实时PCR需求提供最大的可靠性和效率。

位置
BioRad CFX Connect位于1号楼B59室

IRF联系
洛雷恩Junor

网站


BioRad iCycler iQ rtPCR
实时PCR与适当的荧光检测策略相结合,可以确定反应中核酸的初始量。该技术的进步导致了DNA定量和基因表达分析的准确性的显著提高。定量是通过在PCR反应的指数阶段测量荧光的增加来实现的。IRF内的系统可用于:

三色分析用于三个相关目标的扩增
Taqman, Sybr Green,引物系统和分子信标分析
多种样品块格式的0.2ml管,96孔板和384孔PCR板
数据采集实时显示

应用程序

  • 单个样本中管家基因感兴趣基因的定量比较
  • 转基因生物中基因表达的定量检测
  • 单核苷酸多态性(SNPs)分析
  • 当与激光捕获显微解剖结合使用时,实时PCR为比较特定细胞类型的基因表达提供了一种极好的技术,例如来自组织单个区域的癌细胞与正常细胞。

位置
BioRad iCycler iQ位于1号楼B60室

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洛雷恩Junor


Qiagen转子基因Q rtPCR
QIAGEN公司的实时PCR循环仪,转子-基因Q,结合了多种优化设计功能,为您的研究提供卓越的性能和可靠的结果。与优化的QIAGEN实时PCR试剂盒一起,转子-基因Q可以为广泛的应用提供精简的分析。Q-Rex软件是生命科学qPCR应用程序的新操作和分析软件,具有插件概念,可以在不影响既定工作流程的情况下添加新功能。

位置
Qiagen转子- gene Q系统位于9号楼225室。

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杰伊•波茨

网站


TECAN自由EVO系统
TECAN Freedom机器人平台为不同规模和吞吐量提供了先进、可靠的液体处理系统。液体处理和操纵机械臂提供了可扩展的工作区域和可变配置。Freedom EVO工作站可以自动化各种应用程序,包括初级和二级筛选,细胞生长和维护,核酸样品制备,精选,库管理和样品称重。一旦Freedom完成样品制备,样品将自动转移到集成的BioRad BioPlex 200系统进行数据采集和分析。

应用程序

  • 用于样品制备和分析的自动液体处理
  • 细胞因子和磷酸化蛋白的多重分析,使用BioRad提供的试剂盒
  • 通过BioRad提供的试剂盒将抗体偶联到珠子,对多种蛋白质进行多重分析

位置
TECAN/BioPlex 200系统位于9号楼225室

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杰伊•波茨

网站









挑战传统。创建例外。没有限制。

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